Предполагается, что на выполнение завершающих работ будет направлено 1,98 миллиардов рублей.
В 2008 году была завершена первая очередь реконструкции объекта, в рамках которой построены билетные кассы в центральной части здания, электронные справочные системы, информационные табло, эскалаторы, траволатор.
В рамках второй очереди будет построена многоуровневая стоянка, пригородный вокзал, гостиничный и административный комплексы.
Уфимский железнодорожный вокзал входит в число крупнейших транспортных узлов Куйбышевской железной дороги. Ежедневно вокзал принимает около 50 поездов пригородного сообщения и более 400 поездов дальнего следования. Вокзал включает в себя шесть платформ, из них пять - островные и одна - боковая.